Del laboratorioal hospital

Oncology data science

Grup d'oncology data science a Vall d'Hebron

El Grupo de Oncology Data Science (ODysSey) integra la investigación clínica y traslacional con la genómica para la terapia dirigida del cáncer. Analiza bases de datos clinicomoleculares de agentes dirigidos emparejados e informes estandarizados de pruebas de secuenciación de próxima generación. Desarrolla una investigación colaborativa en la genómica del cáncer, la oncología computacional y sus aplicaciones clínicas.

Información destacada

Los proyectos actuales del grupo se centran en la facilidad de los estudios correlativos clinicomoleculares en el VHIO. Proporciona orientación a los médicos oncólogos y biólogos del cáncer durante el desarrollo, validación e interpretación de pruebas "omics" que tienen aplicación clínica directa. También desarrolla y se ocupa del mantenimiento de bases de datos clinicomoleculares, un recurso para los oncólogos médicos, patólogos moleculares e investigadores traslacionales de la institución; así como del mantenimiento de la Gene Drug Knowledge Database (GDKD) (doi: 10.7303 / syn2370773), una base de datos estructurada que utiliza una terminología estandarizada para describir las asociaciones que integran diferentes anotaciones: tipo de tumores, genes, variantes, los patrones de respuesta/resistencia a los agentes aprobados y experimentales bajo investigación clínica y sus respectivos identificadores de PubMed.

Trabaja para el fomento de las actividades de investigación en colaboración con los científicos computacionales de oncología, con el foco en el modelado predictivo y pronóstico, la identificación de los "cancer drivers" y el potencial de convertirlos en dianas en tumores sólidos.

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